Ekergårds fisk och grönt

Kategori: Smakprov på biologi

Ungdomens källa i gmo-grödor

Av , , Bli först att kommentera 1

Här tänkt jag skriva om en populärvetenskaplig bok med den passande titeln: The taste of tomorrow : dispatches from the future of food av Josh Schonwald (journalist tidigare nämn här: länk). Låt mig gå direkt till ett av det mest spektakulära förslagen i boken. Jag tänker på idén att framtidens jordbruk skulle odla växter framavlade till att vara nyttigare än vanliga växter. Idag har vi projekt för att minska undernäringen i världen med hjälp av ris som innehåller betakaroten, ris som innehåller mer protein och kassava som innehåller bl.a. både betakaroten och protein.

De växtprojekten är till för de fattigaste av de fattiga, de som idag lider av undernäring. Det riktigt spektakulära handlar om ett annat spektakulärt ämne, nämligen antiåldrande-medicin*. Om vi en dag verkligen får fram antiåldrande-medicin, kan den medicinen produceras av genmanipulerade växter. Jepp det är ett förslag från boken. Att de grödorna skulle vara både en produktions- och en leveransfunktion för antiåldandemedicin. Att bota cancer var en dröm från förra seklet. Idag vill vi bota åldrandet.

*Om det intresserar någon, forskare på ämnet som nämns i boken är till exempel Cynthia Kenyon, molekylärbiolog på University of California, San Francisco.

Närodlade bananer

Av , , Bli först att kommentera 1

Detta är inlägget där jag frågar om den välmående medelklassen i Umeå vill äta närodlad Frankenstein-mat (frankenfood)? Ni förstår, min yngsta syster och hennes familj har en stuga på västkusten. Jag var där nere i mellandagarna och över nyår. Jag blir så inspirerad till att också ha ett hus på landet och att odla min trädgård. Eller för att vara mer ambitiös odla min åker.

IMG_20181031_102156474_HDR

Bild: Deras växthus.

Men vad skulle jag odla på åkern? Naturligtvis vill man vara klimatsmart, även om det inte är mer än en dagdröm vill man ha en klimatsmart dagdröm. Det anses bättre att odla fleråriga växter än ettåriga växter. Fleråriga växter binder kol över mycket längre tid än bara en säsong. Vilket fick mig att tänka att jag skulle vara en omvänd Karl-Oskar. Istället för att som Karl-Oskar gå in i skogen och röja upp åkrar vid sjön Chisago, med andra ord ersätta fleråriga växter (träd) med ettåriga växter (spannmål, potatis) skulle jag ta över en åker och plantera fleråriga växter på den.

Hänger ni med? Fleråriga växter som passar vårt norrländska klimat är väl bara några enstaka fruktträd och bärbuskar. Men den drömmande, flamboyanta delen av mig vill odla subtropiska fruktträd. t.ex. dadlar, citrus och mandel. Med modern genteknik kan vi åtminstone börja leka med sådana tankar. Främmande växter kan anpassas till vårt klimat. En början skulle vara att sätta in gener som producerar anti-frys-protein i subtropiska fruktträd och se vad som händer. I sin bok The taste of tomorrow nämner Josh Schonwald i förbifarten tanken på att sälja lokalodlade bananer i New England. Nu är bananer kanske lite överkurs. Men det finns ju andra exotiska frukter som vi eventuellt skulle kunna geneditera och odla på en åker utanför Umeå.

Sedan kan man, som omvänd Karl-Oskar, en dag ställa sig på stadens torg och förkunna: ”Kära medlemmar i den akademiska medelklassen, ni ska stereotypt tycka att ’närodlat’ alltid är bra och att sk gmo alltid är dåligt. Vad säger ni om närodlad gmo-grapefrukt? Grapefrukts om dessutom är bra för klimatet eftersom träden binder koldioxid.” Nu, ifall jag inspirerade någon måste jag lägga till att det finns lagar om sådant här. Om du vill syssla med det är första steget kanske att flytta till Kina, där lagarna inte är så hårda. Dessutom jag kan nästan garantera att växtförädling kräver en hel del metodiskt arbete och tålamod.

Återkoppling : mer smakprov på biologi : om mossbräke

Av , , 2 kommentarer 1

Mitt förra inlägg avslutas med citatet: “kunskap har inga gränser”. Jag har ett annat exempel på det. För miljoner år sedan växte det mossbräke – små växter, ormburkar, i släktet Azolla – runt Nordpolen. Det lär ha varit mossbräke som kylde världen från den höga temperaturen på dinosauriernas tid genom att mossbräcken sög upp koldioxid, varpå de dog och sjönk ner till havsbotten.

mossbräke

Mossbräke, bild Wikimedia.

Sommaren 2010 turnerade konstnären Erik Sjödin i Sverige med en utställning om mossbräken för att uppmärksamma växtens potential till odling och dess användningsområde. År senare, 2014, tog ett team forskare i Durham, North Carolina upp tråden och startade ett så kallat crowdfunding projekt för att sekvensera växtens DNA samt DNA för de bakterier som lever i symbios med mossbräken. Detta för att lära oss mer om växten och vilken potentiell roll växten kan spela. Själva DNA-kartläggningen utfördes i Shenzhen, Kina. Vi har ett forskningsprojekt i North Carolina inspirerat av en svensk konstnär, finansieras av människor från hela världen och som använder data framtaget i Kina.

Som framgår mellan raderna i de första meningarna inkluderar förväntningarna på mossbräke att odling av växten ska kunna motverka klimatförändringen genom att suga upp koldioxid. (Men för att vara onödigt övertydlig, hoppas inte för mycket på det.)

Källa: Azolla, a little fern with massive green potential

Värdet av tydliga instruktioner

Av , , 2 kommentarer 1

En av de sista labbarna jag gjorde på universitet var – och bli inte rädda, detta inlägg handlar om något annat – att vi skulle odla Candida albicans och med GFP* som markör avgöra om en gen uttrycks i organismens jäst- respektive hyfer-fas**. Saken är den att det är komplicerat. Vi fick lusläsa instruktioner, vi fick fråga doktoranderna om var och varnat moment. När jag nu är med i stadsodlingen, när jag var med i en studiecirkel om vintersådd, jämför jag med den typen av labbar. Skillnaden är att folk litar på att man vet vad man gör. De ger vaga instruktioner om att att t.ex. plantera några frön, t.ex. persiljefrön, och jag undrar hela tiden om jag gör rätt. Jag blir hela tiden osäker. Det är ju något som alltid sägs om autismspekturmet, att autistiska behöver tydliga instruktioner. Kanske inte lika viktigt som instruktionerna till labbar med potentiellt farliga organismer (C. albicans kan infektera personer med nedsatt immunförsvar och kräver ett ”biosafety level class 2 laberatorium”, vilket låter värre än det är). Men det är trevligt med bra instruktioner.

* Green fluorescence protein. En markör så viktig att metoden belönades med Nobelpris i kemi 2008.
** Om jag ska vara nog är jag inte säker på om ”fas” är rätt ord, men det spelar ingen roll.

Kombuchaläder och NPF-fueled kreativitet (victimless läderslöjd)

Av , , 2 kommentarer 1

Ursäkta svengelskan i rubriken, men har ni hört talas om kombuchaläder? “Svampen” som bildas på en kombuchakultur är uppbyggd av bakteriell cellulosa och den kan användas som ett läderliknande material. Så här ser det ut när amerikanske designern Suzanne Lee arbetar med materialet:

kombuchaläder

Så här ser det ut när jag försökte mig på att framställa kombuchaläder.

Kombucha-läder

Ni ser själva. Det är resultatet av fem försök. Fem kombuchakulurer – gjort på vardera fyra liter sött te – och ett par månaders väntan. Kombuchasvampen växte inte fram som jag hoppades och kulturerna möglar.

Även om det en så länge är ett misslyckande, är mitt jobb med kombuchaläder, ett exempel på kreativitet. En kanal jag följer på Youtube är Gresham College. Ett av de senaste videorna de laddade upp var ett föredrag med Adam Feinstein, författare och autismforskare.

Saken är den att inom femton minuter in i föredrag hävdar han att autism är förknippat med kreativitet. Adam Feinstein hänvisar till vetenskapliga studier. Det är med andra ord mer än spekulationer att autistiska skulle vara kreativa. Och visst jag kan känna mig kreativ. Om min kreativitet är högre eller mindre än genomsnittet är väl svårt att avgöra. Men jag har mer exempel än att jag försöker odla kombuchaläder. Problemet med kreativitet är att det är svårt att genomföra ens kreativa ideér. Om man försöker vara kreativ med levande material som kombuchaläder, blir det kontaminerat, det möglar. Mögel får här symboliserar misslyckanden.

För skojs skull kan jag hävda att jag är killen som kommer med idéer inte den som genomför idéer. Att genomföra saker är för jobbigt och det möglar bara. ”I am not the ’do guy’, I am the ’idea guy'”.

Sedan även om jag skulle få till lika fint kombuchaläder som Suzanne Lee, vill man inte stanna där. Biohackare har föreslagit kombuchabakterier som tillverka silke istället för cellulosa. Ta bara en gen från silkeslarver och sätt in den i kombucha-bakterierna. Det är en kul, kreativ ide, då får man en klump silke, inte en klump cellulosa. Fast det skulle inte vara så lätt som jag får det att låta. Plus att det finns lagar om sådant som man måste följa.

Ps. Jag kan avsluta med att jag tror jag först hörde om kombuchaläder från the thought emporium, en annan Youtube-kanal.

Östasiens blå nejlika

Av , , 1 kommentar 1

I förra inlägget fantiserade jag ihop en självlysande, blå ros som luktar vanilj. Och här följer en skärmdump från det japanska företaget Suntory hemsida och deras blåa ”Moondust” nejlika:

Screenshot_20180921-104143

Använda syntetisk biologi för att odla blåa nejlikor. Det är att kombinera vetenskap och konst. Intressant..

Edit: autokorrekt ändrade ”Suntory” till ”Sjuntorp”. Irriterande, men det är fixat nu. 

Självlysande blå ros : Syntetisk biologi och växter i provrör

Av , , Bli först att kommentera 1

Det sägs ibland att det finns en överlappning mellan egenskaper som behövs för att bli en bra forskare och diagnoskriterer för autismspektrumtillstånd. Det är ett ämne jag kommer att återkomma till. Så läge kan jag nosa på ämnet. Mitt nattduksbord ser ut så här. Det mest ambitiösa är böckerna som återfinns i förgrunden: Plants from test tubes : An introduction to micropropagation, Holly Scoggins, Mark Bridgen, Lydiane Kyte och John Kleyn ; Synthetic aesthetics : Investigating synthetic biology’s designs on nature, Alexandra Daisy Ginsberg, med flera.

 

IMG_20180912_123125204

 

En bok om syntetisk biologi och en om att odla växter i laboratorium. Båda sakerna intresserar mig. Jag vet att många är rädda för nya tekniker. Jag har också varit det. Men samtidigt kan man tvärtom bli lite “triggerhappy” när det kommer en ny cool teknologi. Typ man blir arg över att ”The Man” i Bruxelles förbjuder mig att tillverka en självlysande, blå ros som luktar vanilj i mitt eget hem. (Löjligt överambitiöst exempel, som jag tvivlar på att privatpersoner kan lyckas med.) P.g.a. EUs och Sverige stenhårda gmo-lagar från 1990-talet. Fast EU’s lagar har viktigare konsekvenser än att jag inte får leka med tekniken och böckerna handlar om mer än gmo. Och det finns annat intressant inom design, biologi och ingenjörskonst.

Extrahera DNA ur jordgubbar : Video från mitt sista försök att bli en betydande man

Av , , Bli först att kommentera 1

Sommaren innan jag började läsa Life science på universitetet, bestämde jag mig att spela in ett amatörmässigt klipp om hur man extrahera DNA ur jordgubbar.  Om det låter komplicerat är det tvärt om enkelt. Jag vill inte skryta men nu, bara sex år efter att jag laddade upp videon,  har den nästan ett fyrsiffrigt antal visningar. Med andra ord, i skrivandets stund har den 983 visningar och jag postar videon här med förhoppningen att den snart ska ha 1000 visningar.

Om rubriken. Ni förstår, den sommaren var jag i ungefär samma ålder som Ulrich, huvudpersonen i Mannen utan egenskaper var, när han gjorde sitt sista försök att bli en betydande man. (Om jag inte missminner mig.)